El gobierno de EE. UU. ha planteado dudas sobre la falta de evidencia por parte de México de que el maíz transgénico represente un riesgo para la seguridad alimentaria. Por otro lado, los defensores de la posición mexicana argumentan que se han presentado pruebas que no han sido consideradas por Washington.

La controversia sobre el maíz transgénico se intensificó con nuevas argumentaciones presentadas tanto por el gobierno de Estados Unidos como por defensores de la posición de México. Según Inside U.S. Trade, Estados Unidos cuestionó la justificación retrospectiva de México sobre su política de maíz transgénico y la falta de explicación sobre cómo otros países evaluaron erróneamente la seguridad de este grano.
El panel, establecido bajo el T-MEC, aborda las medidas del decreto mexicano del 13 de febrero de 2023, que prohíbe el uso de maíz transgénico en tortillas y productos alimenticios. Estados Unidos argumenta que México no ha demostrado adecuadamente los problemas de seguridad alimentaria asociados con el maíz transgénico.
México importó maíz de EE. UU. por un récord de $5,470 millones en 2023. Tim Wise del Institute for Agriculture and Trade Policy criticó la falta de compromiso de EE. UU. con las preocupaciones de México sobre la seguridad del maíz transgénico. La USTR sugirió que las medidas mexicanas violan el T-MEC.
Además, EE. UU. cuestionó una nueva disposición del acuerdo relacionada con la protección de los pueblos indígenas.